Struktur organisasi Pejabat Penolong Rektor merangkumi Kampus Sungai Buloh, Kampus Selayang dan Kampus Teluk Intan.

Fakulti Perubatan di Kampus Selayang dan Teluk Intan telah beroperasi sepenuhnya pada tahun 2010. Kampus Selayang menempatkan pentadbiran dan pengurusan Fakulti Perubatan UiTM sehingga Kampus Sungai Buloh beroperasi sebagai Kampus Induk pada April 2012. Kampus Sungai Buloh mempunyai Pusat Latihan Klinikal ( bangunan CTC) yang kini dikenali dengan Pusat Pakar Perubatan UiTM, bangunan akademik dan pentadbiran Fakulti Perubatan, serta dua Kolej Kediaman Pelajar. Pada September 2015, Fakulti Pergigian mula beroperasi di Kampus Sungai Buloh dengan kemudahan blok akademik, Pusat Rawatan Pergigian dan Kolej Kediaman Pelajar. Kampus Selayang menawarkan perkhidmatan perubatan utama kepada orang ramai, manakala Kampus Sungai Buloh menyediakan perkhidmatan primer dan kepakaran dalam kedua-dua bidang perubatan dan pergigian. Kampus Teluk Intan merupakan kampus transit bagi pelajar perubatan yang menjalankan sangkutan (posting) di Hospital Teluk Intan, Hospital Sabak Bernam dan pusat kesihatan daerah dan kecil di sekitar Hilir Perak.